Restaurer l'écosystème intestinal : le pouvoir de la transplantation de microbiote

📝EN BREF

• La transplantation de microbiote fécal (TMF) est une thérapie qui restaure l'équilibre intestinal par le transfert de bactéries saines, aidant les patients à échapper au cycle des échecs antibiotiques et des infections à répétition
• Un essai clinique récent a révélé que la TMF était sûre et bien tolérée chez les patients fragiles en soins de longue durée, présentant moins d'infections sanguines et un recours moindre aux antibiotiques que les soins standard
• Bien que les receveurs de greffe soient toujours porteurs de bactéries résistantes, ils ont subi moins d'infections graves, prouvant que la restauration de la diversité du microbiome renforce les défenses de l'organisme contre les microbes nocifs
• Un registre national de 259 patients a montré que 90 % d'entre eux ont été guéris d'une infection récurrente à « Clostridioides difficile » (C. difficile) après un seul traitement par TMF, avec des résultats perdurant au-delà de six mois
• Des produits approuvés par la FDA, tels que Vowst et Rebyota, rendent désormais la TMF accessible sous forme de capsules orales ou par voie rectale, offrant un nouvel espoir à ceux qui font face à des infections intestinales tenaces

🩺Par le Dr. Mercola

Comme son nom l'indique, la transplantation de microbiote fécal (TMF) est un traitement qui consiste à prélever un échantillon fécal chez un donneur sain pour le transplanter dans le tractus gastro-intestinal (GI) d'un autre patient afin de résoudre ses troubles gastro-intestinaux. La TMF a donné des résultats remarquables pour les infections intestinales persistantes. En fait, une étude a révélé que plus de 90 % des patients souffrant d'une infection récurrente à « Clostridioides difficile » (C. difficile), une maladie qui provoque des diarrhées sévères, des douleurs et de la fièvre, ont été guéris après un seul traitement.

Aujourd'hui, les médecins testent cette même approche dans les établissements de soins de longue durée, où les patients sont souvent porteurs de bactéries multi-résistantes que les antibiotiques ne parviennent plus à contrôler. Voici ce qu'ils ont découvert.

La TMF s'avère prometteuse pour les patients en soins de longue durée confrontés aux bactéries résistantes

Dans un essai clinique récemment publié dans « JAMA Network Open », des médecins d'Atlanta, en Géorgie, ont cherché à savoir si la transplantation de microbiote fécal pouvait aider les patients fragiles en soins de longue durée porteurs d'organismes multi-résistantes (OMR). Ces bactéries sont particulièrement dangereuses car les antibiotiques n'ont plus d'effet sur elles.

Les patients présentant ce type de colonisation courent un risque beaucoup plus élevé d'infections graves, de contamination sanguine et même de décès. L'étude a suivi l'innocuité du traitement, sa tolérance par les patients et son impact sur l'évolution des infections au fil du temps.

• L'essai a porté sur 42 patients en convalescence après une maladie grave dans un hôpital de soins de longue durée : Ces participants constituent une population particulièrement vulnérable en raison de leur immunité affaiblie, de leur exposition fréquente aux antibiotiques et de leurs multiples problèmes de santé. Pour eux, la moindre infection peut se traduire par des jours d'hospitalisation supplémentaires, des traitements invasifs et, parfois, de très faibles chances de rétablissement.

Au cours de l'essai, 10 patients ont reçu un microbiote fécal par sonde de gastrostomie ou par lavement, tandis que 32 patients ont servi de groupe de comparaison et ont reçu les soins standard.

• Les résultats sont prometteurs : La procédure de TMF a été bien tolérée, sans effets secondaires graves liés au traitement. En fait, un seul effet indésirable a été signalé (un patient a eu des vomissements légers après l'administration). Et bien que deux patients soient décédés au cours de la période d'étude, leur décès était lié à des conditions médicales sous-jacentes et n'avait aucun rapport avec la transplantation.

• En ce qui concerne les infections, l'étude a révélé des différences significatives : Aucun des receveurs de greffe n'a développé d'infection sanguine dans les six mois, contre 19 % dans le groupe témoin. Bien que la petite taille de l'échantillon signifie que cette différence n'était pas statistiquement significative, la tendance est importante, surtout si vous ou l'un de vos proches êtes sujet à des infections répétées qui entraînent systématiquement une réhospitalisation.

• Les personnes ayant reçu une TMF ont également eu besoin de moins de jours d'antibiothérapie : Elles présentaient une dominance intestinale moindre de pathogènes nocifs, ce suggère que leur environnement intestinal évoluait dans une direction plus saine.

• Moins d'infections graves ont été signalées, même après six mois : Lors des suivis, les chercheurs ont constaté que même si tous les receveurs de TMF étaient toujours porteurs d'au moins un organisme résistant, ils subissaient moins d'infections graves par rapport aux patients non traités.

C'est important, car être colonisé ne signifie pas toujours être malade ; mais lorsque la colonisation se transforme en infection, elle peut être mortelle. Savoir que la TMF a aidé à réduire le passage de « porteur de bactéries » à « infection potentiellement mortelle » donne aux patients et au personnel soignant une raison d'envisager cette approche dans les cas à haut risque.

• Les chercheurs ont également souligné que 60 % des receveurs de greffe ont acquis une nouvelle catégorie d'organisme résistant pendant la période d'essai : Bien que cela puisse paraître alarmant, gardez à l'esprit que ces patients vivaient dans un environnement où l'exposition aux OMR est inévitable. Le fait qu'ils aient tout de même eu moins d'infections sanguines et moins d'antibiotiques par la suite suggère que la TMF a amélioré la capacité de leur corps à garder ces bactéries sous contrôle, même si la colonisation elle-même n'a pas disparu.

Comprendre la biologie de votre intestin permet de mieux éclairer ces résultats

Votre microbiome intestinal agit comme une équipe de défense interne. Il est composé de billions de minuscules organismes, bactéries, champignons et même virus, qui vivent dans vos intestins. Ces organismes travaillent ensemble pour digérer les fibres, produire des nutriments, réguler votre système immunitaire et même communiquer avec votre cerveau.

• Lorsque vous prenez des antibiotiques, l'équilibre délicat du microbiome de votre intestin est perturbé : Les antibiotiques ne font pas de distinction entre les bons et les mauvais organismes ; par conséquent, ils finissent par anéantir les microbes utiles, permettant aux microbes nuisibles de proliférer sans contrôle, ce qui entraîne divers problèmes.

• La transplantation d'un ensemble équilibré de microbes provenant d'un donneur sain permet au microbiome bénéfique d'entrer en compétition avec les bactéries résistantes : Les bonnes bactéries intestinales limitent la croissance des bactéries nocives et aident l'organisme à réagir plus efficacement. Ainsi, même si les « mauvaises herbes » restent détectables, elles perdent une partie de leur capacité à provoquer des infections déclarées.

• Un autre mécanisme observé par l'étude est l'augmentation de la diversité microbienne intestinale après la TMF : Avoir un microbiome intestinal diversifié est lié à une meilleure résilience. Pour les patients, une plus grande diversité microbienne se traduit par une protection renforcée contre les infections invasives, une meilleure digestion et une moindre dépendance aux protocoles antibiotiques lourds.

La transplantation fécale n'est pas seulement sûre, elle aide aussi à réduire la fréquence des infections graves, comme le montre cette étude. C'est particulièrement important dans les environnements de soins de longue durée, où les options sont rares. Selon un article de « News-Medical.net » :

« Étant donné l'indisponibilité actuelle de thérapies approuvées par la FDA, l'optimisation du conditionnement du microbiote et des stratégies de dosage serait particulièrement bénéfique pour les hôpitaux de soins aigus de longue durée et les autres établissements de santé qui traitent des patients présentant une forte prévalence de colonisation microbienne intestinale multi-résistante. »

Bien que des recherches supplémentaires sur des groupes plus larges soient nécessaires, les preuves actuelles offrent l'espoir que la TMF aidera vous ou vos proches à éviter une nouvelle cure d'antibiotiques agressifs, une hospitalisation prolongée ou des issues plus tragiques. C'est un outil proactif pour restaurer l'équilibre à l'intérieur de l'intestin et faire pencher la balance en votre faveur.

Une vaste étude en conditions réelles confirme que la TMF offre un soulagement durable contre les infections intestinales récurrentes

Une étude de 2020 publiée dans « Gastroenterology » a analysé les résultats du Registre national de la TMF, le premier effort à grande échelle pour suivre la transplantation de microbiote fécal en dehors des essais cliniques. L'objectif était de voir comment la TMF se comporte dans des contextes réels où les patients sont souvent plus âgés, plus malades et souffrent de multiples problèmes de santé. Contrairement aux petites études contrôlées, ce registre a donné une image plus précise de ce qui se passe dans les hôpitaux et les cliniques à travers les États-Unis lorsque les patients reçoivent ce traitement.

• Le registre a inclus 259 personnes, dont l'âge allait de 1 an seulement à près de 100 ans : La majorité de la population étudiée était composée de femmes sexagénaires. Tous les participants avaient souffert d'une infection à C. difficile (ICD), et beaucoup d'entre eux avaient subi plusieurs cycles d'antibiotiques qui n'avaient pas réussi à stopper l'infection.

• L'efficacité a été le résultat le plus frappant : Les chercheurs ont constaté qu'un mois seulement après le traitement, neuf patients sur dix étaient guéris de l'infection, et presque tous n'avaient eu besoin que d'un seul traitement. Plus encourageant encore, lorsque les médecins ont fait le point six mois plus tard, seuls 4 % de ceux qui s'étaient initialement améliorés ont connu une nouvelle récidive.

• Des effets secondaires sont survenus, mais ils étaient généralement légers : Les résultats à court terme ont montré que près de la moitié des patients ont signalé des symptômes tels que des ballonnements, de la constipation ou des douleurs abdominales, mais seulement 1 % ont eu des problèmes graves liés à la transplantation elle-même.

Les médecins ont même noté que la plupart des infections signalées dans les semaines suivant le traitement n'étaient pas liées à la TMF. Il s'agissait notamment d'infections urinaires ou de pneumonies, qui sont de toute façon courantes dans cette population.

• Le calendrier de la guérison a également révélé des informations importantes : Les rechutes ont tendance à se produire dans les deux premiers mois suivant le traitement, ce qui signifie que les patients et le personnel soignant peuvent être particulièrement vigilants pendant cette période. Passé ce délai, les chances de rester indemne d'infection augmentent considérablement.

• Voici une autre caractéristique unique de cette étude : Elle a pu inclure des patients qui, normalement, ne seraient jamais admissibles à des essais cliniques, comme ceux souffrant de maladies inflammatoires de l'intestin (MII), du syndrome de l'intestin irritable (SII) ou d'un système immunitaire affaibli. Ces conditions excluent souvent les personnes de la recherche, alors qu'il s'agit précisément des patients les plus susceptibles de lutter contre une ICD récurrente.

En les incluant, le registre a reflété les réalités de la pratique médicale réelle, montrant que la TMF fonctionne même chez des patients complexes et fragiles.

Si vous avez fait face à de multiples rechutes malgré les antibiotiques, les données de ces deux études suggèrent que la TMF vous donne de très grandes chances de briser ce cycle. Pour les patients et les familles qui cherchent désespérément une solution durable, ces résultats apportent plus que des statistiques, ils rassurent et offrent une voie à suivre.

« Les preuves en conditions réelles deviennent de plus en plus importantes dans les soins de santé et constituent un intérêt récent de la Food and Drug Administration pour la surveillance des événements indésirables et la prise de décisions réglementaires. Les praticiens de la TMF, de concert avec la communauté de recherche, ont la responsabilité de protéger la sécurité des patients recevant une TMF et l'opportunité d'acquérir de nouvelles connaissances considérables sur la biologie du microbiome intestinal humain », ont conclu les chercheurs.

La TMF offre également une protection aux personnes souffrant de maladies du foie

Les personnes atteintes de cirrhose, définie comme une cicatrisation sévère du foie, constituent un autre groupe de patients présentant un risque accru d'infections graves. Celles-ci incluent les infections bactériennes causées par des agents pathogènes multi-résistants. En 2023, des chercheurs britanniques ont lancé l'essai PROMISE pour déterminer si la TMF pouvait être utile pour aider à résoudre ce problème chez de maladies hépatiques les patients atteints.

Cette étude est toujours en cours et accepte des patients. Selon Lindsey Edwards du King's College London, l'un des auteurs de l'étude :

« Si nous pouvons renforcer l'immunité propre des patients hépatiques pour réduire les infections en modifiant le microbiome, nous pourrons réduire la nécessité de prescrire des antibiotiques. Il existe un besoin urgent et non satisfait de s'attaquer à l'infection et à la résistance aux antimicrobiens dans les maladies chroniques du foie. »

• Environ 300 personnes atteintes d'une maladie hépatique avancée participent à l'étude : On demande aux participants de prendre soit une « crapsule » (qui contient des matières fécales lyophilisées de donneurs sains), soit un placebo tous les trois mois pendant deux ans.

• Les crapsules ne se contentent pas de booster la santé intestinale, elles réduisent également le risque d'infection : Les personnes souffrant de lésions hépatiques ont tendance à avoir plus de « mauvaises » bactéries dans l'intestin, ce qui augmente leur risque infectieux. Debbie Shawcross, l'investigatrice principale de l'étude, a déclaré : « Les "crapsules", qui n'ont ni le goût ni l'odeur que leur nom suggère, pourraient offrir un nouvel espoir aux patients atteints de cirrhose qui n'ont plus d'options de traitement. »

• Ce n'est pas la première fois que l'amélioration de la TMF est envisagée pour traiter les affections hépatiques : En fait, en 2021, une équipe de chercheurs chinois a publié un rapport dans « Seminars in Liver Disease » à ce sujet.

«L'intestin humain héberge un microbiote dense et très diversifié d'environ 1 000 espèces bactériennes. L'interaction entre l'hôte et les bactéries intestinales influence fortement la santé humaine », ont-ils rapporté.

« De nombreuses preuves suggèrent que le déséquilibre de la flore intestinale est étroitement associé au développement et au traitement des maladies du foie, notamment les lésions hépatiques aiguës et les maladies hépatiques chroniques (cirrhose, maladie hépatique auto-immune et stéatose hépatique). Par conséquent, il est envisagé que la régulation du microbiote intestinal soit une nouvelle méthode pour le traitement adjuvant des maladies hépatiques. »

Solutions pour réduire les infections et restaurer l'équilibre intestinal

Si vous êtes confronté à des infections répétées ou si vous vous occupez d'une personne en soins de longue durée, vous savez à quel point il est épuisant d'avoir l'impression que les antibiotiques sont la seule option. Le problème n'est pas seulement les bactéries, c'est l'environnement intestinal affaibli qui ne parvient plus à contenir les microbes nocifs. S'attaquer à la cause signifie restaurer l'équilibre de votre microbiome. Voici des mesures pratiques qui aideront à faire pencher la balance en votre faveur.

1. Envisager la TMF : Ces études suggèrent que la TMF est une option digne d'une réflexion sérieuse, et même les patients fragiles en soins de longue durée peuvent bien la tolérer.

La bonne nouvelle est que la Food and Drug Administration (FDA) des États-Unis a approuvé le Vowst en 2023. C'est le premier produit de microbiote fécal pris par voie orale, et il est « approuvé pour la prévention de la récurrence de l'ICD chez les personnes âgées de 18 ans et plus ». Auparavant, en 2022, l'agence avait également approuvé le live-jslm (nom de marque Rebyota). Ce produit de TMF est administré par voie rectale.

2. Les antibiotiques doivent être votre dernier recours, et non votre premier choix : Ces médicaments perturbent l'équilibre de votre intestin, éliminant non seulement les bactéries nocives mais aussi les bactéries protectrices. Même l'utilisation d'antibiotiques à court terme affecte votre santé intestinale à long terme. Ainsi, chaque fois que possible, évitez l'utilisation d'antibiotiques (à moins qu'ils ne soient absolument nécessaires) pour préserver la force de votre microbiome. Envisagez également de prendre un supplément probiotique de haute qualité ainsi que des prébiotiques.

3. Renforcer la diversité intestinale grâce à des améliorations alimentaires progressives : Votre intestin s'épanouit grâce à la variété. Si votre digestion le permet, introduisez lentement une plus large gamme de fruits entiers, de glucides riches en fibres et de légumes bien cuits. Si votre intestin est fragile, commencez simplement avec des aliments comme des fruits avec pulpe ou du riz blanc. Avec le temps, cela donne à votre microbiome plus d'outils pour vous protéger.

4. Prendre des mesures pratiques pour éviter l'ICD : Si vous êtes dans un hôpital ou un établissement de soins de longue durée, l'exposition à « C. difficile » est un risque constant. Réduisez vos risques en pratiquant une hygiène des mains rigoureuse, notamment en vous lavant à l'eau et au savon, car les désinfectants à base d'alcool ne tuent pas les spores de « C. difficile ». Soyez attentif à ce que vous touchez dans les environnements partagés et gardez votre espace personnel propre.

Si l'on vous prescrit des antibiotiques, demandez pourquoi et s'il existe des alternatives, car les antibiotiques à large spectre sont le principal déclencheur de « C. difficile. Adopter une alimentation respectueuse de l'intestin et restaurer l'équilibre après la prise d'antibiotiques réduit également votre risque.

Foire aux questions (FAQ) sur la transplantation de microbiote fécal (TMF)

Q : Qu'est-ce que la transplantation de microbiote fécal (TMF) ?

R : La TMF est une thérapie qui introduit des bactéries saines provenant des selles d'un donneur dans l'intestin d'une personne qui a perdu son équilibre microbien naturel. L'objectif est de restaurer un microbiome sain, ce qui renforce les défenses de votre organisme contre les bactéries nocives, améliore la digestion et réduit le risque d'infections récurrentes que les antibiotiques seuls ne peuvent contrôler.

Q : Quelle est l'efficacité de la TMF pour les infections intestinales tenaces ?

R : La TMF a montré des taux de réussite remarquables. Dans une vaste étude de registre américaine, 90 % des patients souffrant d'une infection récurrente à « Clostridioides difficile » ont été guéris après un seul traitement. Mieux encore, la plupart sont restés sans infection pendant six mois ou plus, brisant ainsi le cycle épuisant des antibiotiques et des rechutes auquel de nombreux patients sont confrontés.

Q : La TMF est-elle sûre pour les patients fragiles en soins de longue durée ?

R : Oui, la recherche montre qu'elle est sûre, même pour les patients très fragiles. Un essai clinique à Atlanta a testé la TMF chez des patients en soins de longue durée déjà affaiblis par la maladie et l'utilisation fréquente d'antibiotiques. La procédure a été bien tolérée, avec un seul effet secondaire mineur signalé (vomissements légers). Aucune complication grave n'a été liée à la transplantation elle-même, ce qui en fait une option réaliste pour les groupes vulnérables.

Q : La TMF élimine-t-elle complètement les bactéries résistantes de l'intestin ?

R : La TMF n'élimine pas toujours entièrement les bactéries résistantes, mais elle aide le corps à les contrôler. Dans l'essai d'Atlanta, tous les patients étaient toujours porteurs d'au moins un organisme résistant après le traitement. Cependant, ceux qui ont reçu la TMF ont eu moins d'infections sanguines et ont eu besoin de moins d'antibiotiques que les patients non traités. Cela signifie que même si des bactéries résistantes subsistent, elles perdent leur capacité à dominer et à provoquer des infections mortelles.

Q : Existe-t-il des produits de TMF approuvés ?

R : Oui, il existe désormais des produits approuvés par la FDA qui facilitent l'accès à la TMF. En 2023, Vowst a été approuvé comme première capsule orale pour prévenir les infections récurrentes à « C. difficile », et en 2022, Rebyota a été approuvé comme produit rectal. Les deux offrent des moyens standardisés et réglementés de délivrer le traitement, donnant aux patients de nouvelles options au-delà des transplantations de selles traditionnelles.