📝EN BREF

  • Des chercheurs de l’Université de Tartu ont découvert que près de 90 % de 186 médicaments courants affectaient la composition intestinale, et près de la moitié provoquaient des modifications microbiennes persistantes, perdurant des années après la fin de leur utilisation
  • Les antibiotiques ont provoqué la perturbation intestinale la plus forte et la plus persistante, avec des changements microbiens mesurables encore évidents six mois après leur utilisation et des effets cumulatifs s’aggravant à chaque traitement supplémentaire
  • Les médicaments non antibiotiques comme les benzodiazépines, les bêta-bloquants, les glucocorticoïdes et les inhibiteurs de la pompe à protons ont également modifié la composition microbienne
  • La consommation de médicaments à long terme expliquait davantage de variations dans la composition du microbiome intestinal que les prescriptions actuelles. Cela montre que l’intestin conserve une « mémoire » biologique des expositions pharmaceutiques passées
  • Le rétablissement de la santé intestinale commence par la réduction des médicaments inutiles, l’éviction des huiles végétales et la consommation d’aliments complets qui aident les bactéries bénéfiques à se rétablir et à rétablir l’équilibre au fil du temps

🩺Par le Dr. Mercola

Lorsque vous saisissez un flacon d’ordonnance, vous pensez probablement au soulagement d’une douleur, d’une infection ou d’une maladie chronique. Le médicament à l’intérieur est conçu pour cibler le problème, corriger un dysfonctionnement ou éliminer un agresseur. Mais pendant que ce comprimé agit sur son objectif, il traverse également l’un des écosystèmes les plus complexes et les plus délicats de votre corps, votre intestin.

Les milliers de milliards de bactéries qui vivent dans votre intestin, collectivement appelées microbiote intestinal, font bien plus que vous aider à digérer les aliments. Elles entraînent votre système immunitaire, fabriquent des vitamines essentielles, protègent contre les pathogènes, régulent le métabolisme et influencent même l’humeur et la santé mentale. Cette communauté microbienne a évolué aux côtés des humains pendant des millénaires, et lorsqu’elle est perturbée, elle affecte presque tous les aspects de votre bien-être.

Des chercheurs de l’Université de Tartu, en Estonie, ont étudié à quel point et avec quelle persistance les médicaments courants peuvent perturber ce monde intérieur. Leurs résultats révèlent comment vos bactéries intestinales ne se contentent pas de se rétablir après la fin d’un traitement. Le microbiome a une mémoire, et les médicaments que vous avez pris tout au long de votre vie l’ont peut-être façonné d’une manière qui persiste longtemps après que les flacons sont vides.

Premières preuves d’altérations du microbiome à long terme

En février 2022, l’équipe de l’Université de Tartu a publié une étude marquante dans Nature Communications, utilisant les données de la Biobanque estonienne, l’une des bases de données de santé populationnelle les plus vastes d’Europe. Leur objectif était de découvrir comment une exposition médicamenteuse passée continue d’influencer le microbiote intestinal des années après le traitement.

• Une analyse à grande échelle a révélé des empreintes microbiennes durables : L’équipe a analysé des échantillons de selles et des dossiers médicaux de 2 509 adultes, combinant un séquençage métagénomique approfondi et jusqu’à une décennie de données de santé électroniques pour comprendre comment les antécédents médicamenteux remodèlent l’écosystème microbien au fil du temps.

•Les antibiotiques ont montré les effets les plus forts et les plus durables : Les participants qui n’avaient pas pris d’antibiotiques depuis au moins six mois présentaient encore des différences microbiennes mesurables par rapport à ceux qui n’en avaient jamais utilisés. Les résultats indiquaient que les effets des antibiotiques s’étendaient bien au-delà de la fenêtre de traitement, altérant la structure communautaire des microbes intestinaux longtemps après l’élimination des médicaments de l’organisme.

• Même quelques cures d’antibiotiques suffisaient à modifier le microbiome : Des changements significatifs dans la composition microbienne sont apparus après seulement trois à quatre cures d’antibiotiques. Cette constatation était frappante, étant donné que la moitié des participants à l’étude avaient pris plus de quatre cures, et que l’Estonie est l’un des pays européens consommant le moins d’antibiotiques, suggérant un effet encore plus marqué dans d’autres populations. Les chercheurs ont souligné :

« Les effets de la surutilisation d’antibiotiques sur la structure de la communauté microbienne normale et la santé ont été rapportés chez l’homme et la souris. Il a été démontré qu’après un traitement antibiotique, certains membres de la communauté microbienne ne retrouvent pas leurs niveaux d’avant traitement et disparaissent de la communauté de façon définitive .»

• L’utilisation répétée d’antibiotiques a provoqué une perturbation cumulative : Chaque cure supplémentaire a laissé une marque plus forte sur le microbiome, un schéma qu’ils ont décrit comme additif. Ces résultats ont fourni des preuves claires que l’utilisation répétée d’antibiotiques accumule ses effets au fil du temps, modifiant la composition microbienne de l’intestin de manière dose-dépendante.

• Les antécédents médicamenteux faussent les associations entre microbiome et maladies : Lorsque les chercheurs ont ajusté leurs modèles pour tenir compte d’une utilisation antérieure d’antibiotiques, de nombreux liens précédemment rapportés entre microbes spécifiques et maladies se sont affaiblis ou ont disparu. Cela a révélé que l’exposition antérieure aux antibiotiques est un facteur de confusion majeur dans la recherche sur le microbiome et doit être prise en compte pour éviter des conclusions trompeuses.

•Les médicaments non antibiotiques ont également modifié la composition intestinale : Plusieurs classes de médicaments courants, y compris les antidépresseurs, les bêta-bloquants et les glucocorticoïdes, étaient associées à des changements microbiens mesurables. Bien que leurs effets aient été moindres que ceux des antibiotiques, ils ont tout de même contribué à des changements à long terme dans la diversité microbienne et la fonction métabolique.

• La combinaison de données sur le mode de vie et les médicaments a expliqué une variance significative : En intégrant les antécédents médicamenteux aux données cliniques et de mode de vie, les chercheurs ont pu expliquer plus de 10 % de la variation de la composition du microbiote intestinal dans la population étudiée, un chiffre substantiel compte tenu de la complexité du microbiome.

Cette étude a fourni des preuves convaincantes que l’intestin conserve une mémoire biologique de l’exposition médicamenteuse passée. Elle a démontré que les antécédents médicamenteux à long terme, et pas seulement les prescriptions actuelles, jouent un rôle décisif dans la formation de la composition, de la diversité et de la résilience du microbiome humain.

Une étude récente révèle l’empreinte microbienne à long terme des médicaments courants

Les dernières recherches de l’Institut de génomique de l’Université de Tartu ont approfondi les découvertes antérieures, révélant comment un large éventail de médicaments couramment prescrits, pas seulement les antibiotiques, laissent des empreintes microbiennes durables. Publiée dans la revue mSystems, il s’agit de la première évaluation systématique à grande échelle de la manière dont l’utilisation à long terme de médicaments affecte le microbiote intestinal pour des centaines de médicaments couramment prescrits.

• Un suivi à long terme a révélé des relations de cause à effet : Au sein de la plus grande cohorte de la Biobanque estonienne, les chercheurs ont suivi 328 individus sur une moyenne de 4,4 ans, collectant des échantillons répétés de microbiome pour surveiller comment l’initiation ou l’arrêt de médicaments spécifiques modifiait la composition intestinale. Ces données longitudinales ont permis à l’équipe d’identifier des relations de cause à effet plutôt que de simples corrélations, ce que les études transversales ne peuvent pas réaliser.

• La plupart des médicaments ont produit des changements microbiens mesurables : Sur 186 médicaments analysés, près de 90 % étaient liés à des changements mesurables dans le microbiote intestinal. Parmi ceux-ci, 46,7 % ont produit des effets qui ont persisté même après l’arrêt du médicament. Ces effets durables s’étendaient au-delà des antibiotiques pour inclure de nombreux médicaments non antibiotiques largement utilisés.

• Les médicaments pour le cerveau et le cœur ont laissé des empreintes microbiennes distinctes : Les antidépresseurs, les benzodiazépines, les bêta-bloquants, les inhibiteurs de la pompe à protons (IPP) et les glucocorticoïdes ont produit certains des changements microbiens les plus reconnaissables et persistants. Les empreintes microbiennes étaient si distinctives que les chercheurs pouvaient déduire une utilisation médicamenteuse passée uniquement à partir de la composition du microbiome.

• Les prescriptions passées ont eu un impact plus important que les prescriptions actuelles : Lorsque les chercheurs ont comparé la part de la variation du microbiome expliquée par l’utilisation de médicaments, ils ont constaté que l’exposition médicamenteuse passée rendait compte de plus de différences dans les profils microbiens que les prescriptions en cours. L’utilisation à long terme de médicaments expliquait 0,74 % de la variance du microbiome, contre 0,47 % pour les prescriptions actives.

• Les benzodiazépines ont produit une perturbation de niveau antibiotique : Parmi tous les groupes de médicaments étudiés, les benzodiazépines ont provoqué certains des changements microbiens les plus étendus. Leur impact à long terme ressemblait à la perturbation typiquement observée après l’utilisation d’antibiotiques à large spectre, une découverte inattendue pour une classe de médicaments principalement prescrite pour l’anxiété.

• Des différences chimiques subtiles ont conduit à des résultats microbiens uniques : Même les médicaments d’une même classe avaient des effets nettement différents. Par exemple, les benzodiazépines diazépam et alprazolam ont provoqué des changements microbiens distincts, suggérant que de petites variations dans la structure moléculaire peuvent entraîner des résultats à long terme très différents dans l’écosystème intestinal. Les chercheurs ont souligné :

« Compte tenu de la popularité croissante des benzodiazépines, la différence notée dans les effets sur le microbiome entre l’alprazolam et le diazépam pourrait être une information précieuse pour les futures décisions thérapeutiques et justifie une enquête plus approfondie.
De plus, la même notion pourrait s’appliquer à d’autres médicaments, où des médicaments prescrits pour la même affection peuvent avoir une magnitude d’effets inégale sur le microbiome et, par conséquent, le choix du médicament causant le moins de dommages à long terme sur le microbiome pourrait être favorisé .»

• Des échantillons de suivi ont confirmé des effets microbiens directs : Lorsque les participants ont commencé ou arrêté certains médicaments, comme les inhibiteurs de la pompe à protons (IPP), les inhibiteurs sélectifs de la recapture de la sérotonine (ISRS) ou les antibiotiques de la classe des pénicillines, leurs communautés microbiennes intestinales se sont déplacées dans des directions prévisibles.

• Les antécédents médicamenteux sont un facteur confondant caché : Ces études révèlent un angle mort majeur dans la recherche sur le microbiome et la santé. De nombreuses études qui tentent de lier les bactéries intestinales à une maladie ne tiennent pas compte des antécédents médicamenteux, or ce facteur explique une part significative de la variabilité autrefois attribuée à d’autres causes. Les chercheurs ont conclu :

« [N]ous soulignons l’importance de prendre en compte l’historique de la consommation de médicaments lors de l’évaluation des associations maladie-microbiome. Ensemble, nos résultats élargissent la compréhension des effets des médicaments sur le microbiome, et nous encourageons les chercheurs à se concentrer sur les effets à long terme des médicaments chaque fois que cela est possible .»

• La polymédication représente un problème de santé publique croissant : Les conclusions ont des implications majeures en santé publique, en particulier pour les personnes âgées et les personnes gérant des maladies chroniques, qui prennent souvent plusieurs médicaments au fil du temps, créant une perturbation microbienne cumulative et durable. Connaître la manière dont ces expositions médicamenteuses qui se chevauchent remodèlent l’intestin est essentiel pour une modélisation précise des maladies, une planification des traitements et une interprétation des données cliniques.

Bien que les résultats de l’étude puissent sembler décourageants, ils révèlent également une vérité importante : le microbiome n’est pas statique. Tout comme les médicaments peuvent laisser une empreinte, vos choix quotidiens peuvent la réécrire par l’alimentation, le mouvement et des soins constants.

Reconstruire l’intestin, Étapes vers le rétablissement

L’intestin a une capacité remarquable à guérir. Le même écosystème qui se souvient des années de consommation de médicaments détient également le pouvoir de se reconstruire une fois que les bonnes conditions sont rétablies. Le rétablissement commence par éliminer ce qui continue de l’enflammer ou de l’appauvrir, puis en fournissant la nourriture constante qui permet le retour de l’équilibre microbien.

1. Examiner et réduire les médicaments inutiles : Commencez par examiner les médicaments que vous prenez et travaillez avec votre professionnel de santé pour déterminer lesquels sont encore essentiels. Beaucoup de personnes continuent des prescriptions longtemps après que leur besoin initial a disparu. Rationaliser votre traitement réduit la charge chimique sur votre intestin et donne à votre microbiome la stabilité dont il a besoin pour se rétablir.

2. Éliminer les facteurs de stress intestinaux persistants : Même après des ajustements médicamenteux, les apports alimentaires quotidiens peuvent maintenir votre intestin enflammé. Les graisses polyinsaturées (AGPI), en particulier l’acide linoléique (AL) des huiles végétales et des aliments ultra-transformés, favorisent le stress oxydatif qui affaiblit la barrière intestinale. Remplacez-les par des graisses stables comme le beurre de pâturage, le ghee, le saindoux ou l’huile de coco. Ce changement réduit l’inflammation et aide la paroi intestinale à se réparer.

3. Stabiliser votre santé intestinale : Une fois les irritants éliminés, votre intestin a besoin d’un carburant constant pour retrouver son rythme. Normalement, cela commencerait par des aliments riches en fibres pour nourrir les bactéries intestinales, mais lorsque votre intestin est compromis, il est préférable de commencer par des glucides à faible résidu, bien tolérés, faciles à digérer et peu susceptibles de fermenter excessivement.

Visez environ 200 à 250 grammes de glucides propres et non transformés chaque jour, provenant de sources saines et non transformées. Les meilleurs exemples incluent les fruits entiers comme les pommes, les baies et les bananes, ainsi que le riz blanc bien cuit et les patates douces.

Au fur et à mesure que votre digestion s’améliore, commencez à ajouter des légumes riches en fibres, des céréales complètes et des amidons résistants à votre alimentation pour favoriser la diversité microbienne et soutenir la production de butyrate, un acide gras à chaîne courte qui nourrit vos cellules du côlon et est essentiel à l’intégrité intestinale. Pour un aperçu plus approfondi de cette approche, lisez « Fatigue, digestion lente, inconfort intestinal ? Ce nutriment est peut-être la pièce manquante »

4. Reconstruire la diversité microbienne : Lorsque votre digestion semble stable, commencez à réintroduire des microbes bénéfiques. Commencez par de petites portions d’aliments fermentés comme le kéfir, le yaourt nature au lait de pâturage, la choucroute ou le kimchi. Si le temps ou la tolérance limite les aliments fermentés, choisissez un probiotique de haute qualité avec des souches connues pour compléter votre type d’intestin. Introduisez un produit à la fois et surveillez la réponse de votre corps.

5. Soutenir le rétablissement avec des prébiotiques : Une fois les bactéries saines rétablies, elles ont besoin de nourriture pour prospérer. Les aliments prébiotiques, comme l’ail, l’oignon, le poireau, l’asperge et même le lait, contiennent des composés naturels comme les fructo-oligosaccharides et les galacto-oligosaccharides qui nourrissent les microbes bénéfiques. Vous pouvez également utiliser des suppléments prébiotiques s’ils sont tolérés.

6. Maintenir la vigilance avec les prescriptions futures : Si vous avez besoin de nouveaux médicaments, la protection de votre microbiome doit faire partie de votre plan global. Combiner les prescriptions avec des nutriments de soutien, une alimentation équilibrée et des stratégies probiotiques ou postbiotiques peut prévenir un nouveau cycle de perturbation microbienne. Discutez de ces stratégies avec votre professionnel de santé pour que votre rétablissement reste à la fois sûr et durable, et ne se fasse pas au détriment de la santé microbienne à long terme.

Votre microbiome porte l’empreinte de ce que votre corps a vécu. Il change avec la nourriture que vous mangez, les habitudes que vous gardez et les traitements que vous avez suivis. En faisant des choix délibérés qui réduisent les dommages et soutiennent la réparation, vous aidez cet écosystème interne à retrouver son équilibre.

Questions fréquemment posées (FAQ) sur les perturbations intestinales liées aux médicaments

Q : Comment les médicaments affectent-ils votre microbiote intestinal ?

R: De nombreux médicaments courants modifient la composition de votre microbiote intestinal, parfois pendant des années après que vous ayez cessé de les prendre. Votre microbiome ne se réinitialise pas automatiquement lorsque le traitement se termine, il conserve une mémoire biologique de vos antécédents médicamenteux qui peut continuer d’influencer votre santé au fil du temps.

Q : Combien de temps les médicaments peuvent-ils affecter mon microbiote intestinal ?

R: Certains médicaments peuvent modifier vos bactéries intestinales pendant des mois, voire des années après que vous ayez cessé de les prendre. Des recherches de l’Université de Tartu ont montré que près de la moitié de tous les médicaments analysés laissaient une « empreinte » microbienne durable

Q : Seuls les antibiotiques endommagent-ils le microbiote intestinal ?

R: Non. Bien que les antibiotiques soient les plus perturbateurs, les études ont révélé que de nombreux médicaments non antibiotiques, y compris les antidépresseurs, les bêta-bloquants, les inhibiteurs de la pompe à protons (IPP), les benzodiazépines et les corticostéroïdes, remodèlent également votre microbiote intestinal. Certains de ces effets ont duré aussi longtemps que ceux causés par les antibiotiques, en particulier lorsque plusieurs médicaments étaient utilisés ensemble.

Q : Qui est le plus à risque de dommages intestinaux à long terme dus aux médicaments ?

R: Les personnes qui prennent plusieurs prescriptions, en particulier les personnes âgées et celles gérant une maladie chronique, courent le risque le plus élevé. L’utilisation de plusieurs médicaments au fil du temps crée une perturbation microbienne cumulative, une condition connue sous le nom de polymédication. Plus les médicaments pris sont nombreux, plus l’écosystème intestinal s’éloigne de l’équilibre.

Q : Votre intestin peut-il se rétablir d’une perturbation liée aux médicaments ?

R : Oui. Le microbiome est résilient une fois que les facteurs qui le perturbent sont éliminés. Le rétablissement commence par examiner vos prescriptions avec votre médecin, réduire les médicaments inutiles, éliminer les graisses inflammatoires comme les huiles végétales et manger des aliments complets et non transformés qui favorisent la guérison. Avec le temps, ces changements permettent le retour de l’équilibre microbien.